順治二年(1645年)七月，汪兆麟獻策屠蜀。次日，屠城成都，先殺男子，後逼婦女投江，被屠戮者不計其數，《紀事略》中說“不下四五百萬”，實際數不可考。不久，又以“特科”的名義，騙四川的鄉紳、士子、醫卜僧道雜流到成都，後全部屠殺，被殺者萬餘人。
順治三年(1646年)年正月，大殺大西軍中的川籍士兵，除十四歲以下者全部盡殺。該年上半年，派兵分剿成都府屬三十二州縣，定例每殺一人，剁兩手掌、割兩耳及一鼻解驗，準一功，婦女四雙手準一功，小孩六雙準一功。直至五月各地剿殺部隊才全部回成都。
順治三年(1646年)春，張獻忠在彭山江口大敗於明軍楊展，敗退成都。
順治三年(1646年)五月，明總兵曾英進軍成都，張獻忠遂棄成都，向川北轉移。由於受到進剿追擊，張獻忠於是將成都劫掠一空，另有一說說張獻忠在撤軍時，嫌士兵太多於是大戮士兵，並殺盡軍中隨軍婦女，但此說和其他文獻想矛盾，較不可信。
當時“張賊屠蜀，民殆盡;楚次之，而江西少受其害。事定之後，江西人入楚，楚人入蜀。故當時有‘江西填湖廣、湖廣填四川’之謠”。
《聖教入川記》說張獻忠“性情暴虐，每日均殺人。大西的官員本有九百人。張獻忠離開成都時還有700人。到他臨死時只有25人”。
