在關外，八旗亦兵亦農。順治元年，八旗從龍入關，坐鎮北京，爲了鎮壓漢族的反抗，其軍事職能越來越突出，八旗子弟漸漸退出生產，以挑甲拿兵餉爲生，成爲滿洲貴族維持異族統治的基石，享有各種特權。綜清之世，旗人與民人界限分明，八旗猶如國中之國。當然其內部並非鐵板一塊，由於族羣的差異、歸降方式及時間的不同等，內部旗人身份也存在區別。
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滿洲八旗、蒙古八旗、漢軍八旗之間的差異
滿洲八旗與統治者同屬一個民族，且滿洲各舊部歸降較早，在三部之中地位最高。蒙古在清代被滿族統治者引爲盟友，世代聯姻，著名的孝莊太后即是蒙古科爾沁部落之人，蒙古八旗在八旗內部僅次於滿洲八旗。而漢軍則多來源於投降的明軍，歸降較晚，且相較於蒙古而言，漢人與滿洲的文化差異更大，滿洲貴族對於漢人的戒備更重，在八旗內部地位最低，所享有的待遇也相較滿洲、蒙古八旗爲低。清制，滿洲八旗、蒙古八旗2丁一人披甲，而漢軍一般爲5丁一人披甲。入關時，正當戰爭頻繁之際，滿洲貴族仍僅允許漢軍4丁一人披甲，後又恢復常制。另一方面，在乾隆時期爲了解決八旗核心部分滿洲、蒙古的生計問題，還出現逼漢軍出旗的現象。
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上三旗與下五旗的區別
在關外時，努爾哈赤創建了極具特色的八旗共政國政制度，八旗的地位是平等的，但其子皇太極坐上汗位後，先後廢除諸貝勒按月分值制度、皇上與三大貝勒俱南面坐受制度，取得了獨尊的地位，並採取了多種手段，奪取其他旗主之牛錄，後獨掌三旗。順治時期，定製兩黃旗、正白旗爲上三旗，爲皇帝直接統轄之民，地位相較下五旗爲高，宮廷侍衛也均在上三旗滿蒙軍中選任。
內務府三旗與八旗的區別
努爾哈赤將旗主、貴族包衣（即家的人）編成單獨的牛錄，長官稱包衣昂邦，入關後，順治帝將上三旗之包衣劃歸內務府管理，此即內務府三旗。雖滿族之包衣，並非如羅馬之奴隸，且多有因皇帝開恩領肥差富貴者，如曹雪芹之祖。但終究有人身依附關係，需爲皇室服務，如參加秀女挑選，入宮服侍皇室，相較八旗而言，地位較低。
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內部府三旗內部佐領與管領的區別
入關之初，內務府共有9個滿洲佐領，12個旗鼓佐領，其他則多爲管領。清代，以兵部尚書身份投降的洪承疇、吳三桂之舅祖大壽、平定臺灣的施琅均入內務府八旗，內務府佐領下人對皇帝自稱奴才，雖爲依附關係，但因爲是皇帝家人，常也因此受皇帝照顧，且也有宿衛皇宮之職，並未真正意義上的奴隸。
