倫敦大瘟疫是指一場於1665年到1666年發生在英格蘭的大規模瘟疫。在這場瘟疫中，有七萬五千到十萬人喪生，超過當時倫敦總人口的五分之一。它在歷史上被確定爲淋巴腺鼠疫(bubonic plague)引起的大面積黑死病，由人通過跳蚤感染了鼠疫耶爾森菌。1665年這場傳染病是淋巴腺鼠疫在英格蘭的最後一次大規模爆發。
瘟疫的來源有兩種說法。一種說來自法國，1665年4月，兩個法國海員昏倒在倫敦西區特魯裏街與朗埃克路口，後來他們身上攜帶的病毒引起了大範圍的傳染。另一種說法是說鼠疫病毒來自荷蘭，這種疾病自1599年起就在荷蘭當地傳播了。瘟疫襲擊的第一個地區是倫敦的聖吉爾斯教區。1664年底至1665年初的冬天，就已經有病例在那裏出現，但直到1665年開春，由於人口的大量增加和衛生條件的急劇惡化，疾病才大規模迅速地傳播開來。到了1665年7月，瘟疫已經遍佈倫敦城。當時的國王查爾斯二世以及他的家人都被迫離開了倫敦前往牛津郡，但市長和參事仍在堅守崗位。而一部分神職人員、醫生和藥劑師也因此忙碌了整個夏天。滿大街都是負責瘟疫的醫生，雖然他們當中很多人都沒有執照。
由於這場瘟疫的蔓延非常之快，人們不得不將患病者所住的房子都連人封死，在緊閉的大門外漆上紅十字，上面寫上“上帝保佑”的字樣，嚴禁任何人出入。每天只是在限定的時間，由專人從窗口送進食物和水。成千上萬的病人就是在這種惡劣的情況下悽慘地死去，最多時一週死去的就不下萬人。時至9月上旬，原來熙熙攘攘的倫敦城竟然完全變成了一座寂靜的死城。所有的店鋪關了門，街上幾乎看不到行人，路旁長滿了茂盛的雜草。城內唯一能夠不時打破沉寂的工作，便是運送屍體。每到夜晚，運屍車“咕隆，咕隆!”的車輪聲和那哀婉的車鈴聲，讓人聽了毛骨悚然。最初，這項掩埋工作只是在深夜進行，後來死者人數太多了，不得已也在晝夜進行了。死者的屍體被橫七豎八地裝到運屍車，運到各處的埋屍坑。在那裏，負責埋屍的工人們往往蒙面捂嘴，搖着鈴，口中念着：“安息吧!”匆匆把屍體倒入坑內，掩上薄土後，匆忙離開。
記錄顯示倫敦的死亡人數從每週1000-2000人持續上升，到1665年九月，平均每週已經有7000人死亡。到深秋時候，狀況得到了一定程度的控制。到1666年二月，城市被認爲安全到可以迎接國王了。而同時，由於與歐洲大陸的商貿交流，瘟疫傳到了法國。此後直到1666年九月，瘟疫仍在溫和的流行。9月2日和3日，倫敦城遭遇了一場大火，燒燬了大部分遭到感染了的房屋，這是狀況好轉的開端。另一個可能的原因是，大部分被感染的人羣都已經死亡了。此後倫敦城在大火的基礎上重建，在這場瘟疫過後又獲得了的新生。
