乾符五年(878年)正月初一，義軍攻佔羅城。山南東道節度使李福率兵來救，敗義軍於荊門。王仙芝解圍而去，到申州(治今河南信陽)東又被招討副使曾元裕擊敗，義軍損失2萬。這時，唐王朝以宋威“殺尚君長非是”，鎮壓起義“無功”，解除其兵權，擢升曾元裕爲招討使，潁州刺史張自勉爲招討副使，又調西川節度使高駢任荊南節度使兼鹽鐵運轉使，集中優勢兵力，加緊圍剿王仙芝。
乾符五年(878年)二月，王仙芝義軍被曾元裕包圍於黃梅(今湖北黃梅西北)，經過無數場激烈的戰鬥，義軍5萬餘人英勇犧牲，並且在突圍中王仙芝不幸戰死。餘部渡江轉戰江南，另一部由尚讓率領投奔黃巢繼續戰鬥。
正面
王仙芝起義是中國古代歷史上一次重要的農民起義運動，極大地打擊了唐朝封建政府的腐朽統治，推動了歷史的向前發展，影響深遠，其後續的黃巢起義更是迫使唐朝政府退隨到了四川，直接打擊了封建最高統治者。
作爲這次農民起義的主要領導者的王仙芝，集中體現了中國古代農民階級的特質和寶貴品質，既具有革命性，又具有軟弱、妥協和侷限性;既敢於反抗剝削，又對地主階級抱有幻想。回顧王仙芝起義的整個過程，從起義開始到戰死，三年之間。
負面
王仙芝提出“平均”口號，對動員農民起而反抗唐朝黑暗統治具有很大推動作用，這是中國古代農民階級的革命性與反抗性的集中體現，值得讚揚，但是在勝利面前經不住考驗，在失敗面前經不住打擊，一再向地主階級乞降、退讓，削弱了起義力量，分裂了革命陣營，導致了對敵鬥爭的失敗，不能不說他的失敗，是中國古代農民階級的階級侷限性的必然結果。但是，在當時的歷史條件下，農民階級很好地完成了歷史所賦予的任務，只是因爲封建小農經濟完全依賴於土地等生產資料，而土地等生產資料又是屬於地主階級所有，才致使封建小農對地主階級產生妥協、退讓的心理，才使他們不敢完全地打破封建統治秩序，才使得他們不能夠向更高的革命階段邁進，取得更爲輝煌的革命成果。
