亞特蘭蒂斯的滅亡，人們相信與大洪水有關。史前大洪水，是指史前時代地球突然被來歷不明的海嘯包圍，強而有力的洪水，使高山在波濤中顫抖，陸地在鉅變中呻吟……以雷霆萬鈞之勢，咆哮着衝向陸地，吞沒了城市谷地，以及地球上的所有生靈。
有人認為是人類傳訛附會的記憶，也有人認為是千真萬確的事實。孰是孰非，千百年來仍無定論。
在有關於亞特蘭蒂斯覆滅的記載中，古代墨西哥着作抄本(即《梵蒂岡城國古抄本》)記錄着人類文明毀滅於巨浪滔天的大洪災。亞特蘭蒂斯沉沒於大西洲。而且亞特蘭蒂斯沉沒的時間節點與大洪水出現的時間節點相吻合。
英國的民族學家弗雷澤曾指出：在北美洲，中美洲，南美洲的130多個印第安種族中，沒有一個種族沒有以大洪水為主題的神話。事實上，記錄大洪水的並不限於美洲的印第安人，在世界各大陸上生活的民族中幾乎都有關於大洪水的記載。大約1萬2千年前左右，上一期人類文明曾遭受一次特大洪水的襲擊，那次洪水也導致大陸的下沉。考古學家陸續發現了許多那次大洪水的直接和間接證據。人類文化學家也通過研究世界各地不同民族關於本民族文明起源的傳説則發現：世界各地不同民族的古老傳説都普遍
述及人類曾經歷過多次毀滅性大災難，並且如此一致地記述了在我們本次人類文明出現之前的某一遠古時期，地球上曾發生過一次造成全人類文明毀滅的大洪水，而只有極少數人得以存活下來。全世界已知的關於大洪水的傳説有600多則。例如，中國及日本、馬來西亞、老撾、泰國、印度、澳大利亞、希臘、埃及及非洲、南美洲、北美洲的土著等各個不同國家和民族的傳説中都保留着對一場大洪水的記憶。
雖然這些傳説產生於自各個不同的民族、文化，卻擁有極其相似的故事情節和典型人物。對於這一切證據和現象，用偶然或巧合是根本無法解釋的。
在世界上任何一個有足夠時間跨度的民族的歷史和傳説中，都有着驚人相似的“大洪水”傳説。而且在傳説中的時間、地點、人物、內容都有着驚人的相似之處!綜上所述，我們是否能得出這樣一個結論：一、 大洪水確實發生過，二、 一種巨大的能量的突然作用，導致了這次“史前大洪水”或者更確切的説，是“史前全球性海浸事故”。而如此巨大的能量，應當而且只能來自於我們的星球之外。三、這次“史前大洪水”造成了一個史前文化斷層，就像傳説中消失的“亞特蘭蒂斯”。
一項研究證實，早在8000多年前北大西洋巨大冰蓋的融化曾使海平面大幅上升，科學家指出，據西班牙《世界報》25日報道，英國埃克塞特大學和澳大利亞伍倫貢大學的科學家指出，發生在距今8740年至8160年間的北美勞倫太德冰蓋融化，造成了近10萬年來地球上最大規模的淡水增加，地中海海平面也因此上升了1.4米。
研究指出，海平面的上升導致當時還是一個淡水湖的黑海被鹹水淹沒，造成黑海海水在大約8200年以前增多變鹹。生活在黑海沿岸一帶的新石器時代的農業人口受影響最大，他們無法繼續耕作。洪水最嚴重時，有72700平方公里的土地被淹，這一時期持續了約30多年。同樣的現象還出現在地中海沿岸，大約1120平方公里的土地被水淹沒。這一切造成了14.5萬人類向西遷移，尋找更適合的耕地。
他們的到來加速了當地的社會變革，推動了生活方式的改變，這很可能是早期農業向歐洲其他地區傳播的過程。研究小組負責人英國教授克里斯·特尼指出，這一事件被代代相傳，給人留下的印象是全世界都發生了大洪水。這一事件可能是《聖經》中記載的諾亞方舟拯救人類的故事起源。
