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燕王朱棣找到了機會發動靖難之役並取得成功，原因有很多，其中有一點是因爲明太祖立的《皇明祖訓》，此外在洪武31年，周、代、湘、齊和岷王五大諸王都被降爲庶人，而這一切都始於明朝在位僅4年的建文帝朱允的削藩政治舉措，同時還命遼王回京師，寧王的護衛被削。這一系列措施引起了諸王的不滿。
朱棣成功上位後，又拿《祖訓》出來說事，說自己是不得已爲之，大致就是說：我是高皇帝的嫡子，祖宗有訓說"朝廷內有奸臣，諸王要起兵討伐"，我嚴格遵循條章，起兵去剷除君主身邊的奸臣，這些都是不得已而爲之。
朱棣和朱允炆不同，他並沒有繼續奪爵，但是參考之前他選擇了繼續削藩，但他的手段卻要高明很多，這也穩固了他的統治地位，官官相見對諸王是一個極大的限制，約束了他們的行爲，這些都減弱了諸王的權勢。而開始朱棣以《祖訓》爲藉口且以武力獲取皇位，還在登位之後爲了拉攏諸王，對他們施以恩德去感化他們，用此來證明自己登位的合理性。
具體如何削弱藩王的權力呢?不停的分化藩王內部，將他們的親信分開，將他們遷移到內地，這樣也方便約束。在永樂二年，下令把遼王朱植從廣寧調到荊州，同時將還分化了遼王的三個貼身護衛，兩個繼續在廣寧。
而朱棣削藩的手段之一就是編造藩王的罪名，藉此來削弱王府護衛勢力。在永樂元年六月、永樂元年九月與永樂六年正月、永樂十年、永樂十八年分別削弱了代王朱桂、岷王、遼王朱植和周王朱楠四個諸王。代王朱桂因爲違背了《祖訓》，虐待軍民，而且還目無兄長，目無君王，被調走了三護衛，只留下了30名校尉作爲他的隨從。後面因爲他有所過，便只是恢復了官員設置，並沒有歸還三護衛，直到宣宗上位才被允許恢復。
岷王朱梗有兩次被革，在永樂元年九月，也沒說有什麼罪，便被革去雲南三護衛，後因表現好，又被恢復了，這纔有了第二次。在永樂六年正月，因爲傲慢無禮且屢次訓教都不改，被罷了長史司審理等官員，護衛自然被削了，留了百餘校尉。遼王朱植在永樂十年因有罪而被削去護衛及儀衛司，但留了三百校尉三百。
朱棣削藩的另一重要手段就是將涉嫌謀逆的親王奪爵除去封國。
遠一點的有，永樂十五年，谷王朱穗因謀不軌被削去了職位爲庶人連同革去了護衛及長史司衙門。在永樂四年，齊王因謀逆罪被除封奪爵降爲庶人。並且命山東的都司、布政司和按察司革去齊府青州二護衛，並且將齊府長史司和儀衛司官軍校尉分別調往了附近衛所。
在剝奪藩王的軍事指揮權上。過去，在洪武時期，諸王帶兵打仗都能制約公侯，就是軍事統帥。而朱棣上位之後，首先改變的就是這個傳統並逐步削弱諸王的軍事權力。
最早見於在建文四年七月，朱棣給岷王朱梗的信中便有此意，他要求岷王做決定前要與朝廷所派遣的都督商量，大概就是說：今天派遣了都督袁宇去了雲南，看守一方，你有事可以與他一起商量再行動，這個地方很重要，你要注意安全，別亂走動，讓那些諸王有所敬仰，別辜負了我對你的看重。由此改變了過去太祖時期親王節制將帥的，這種格局。
其次，到永樂十三年十一月，朱棣命晉王朱濟橫，秦王志堰，周王朱楠和肅王朱模，從自己的護衛裏選步兵和騎兵共五千人，至次年正月赴真定，由朝廷派人統一操練。且在永樂一朝的時候，有戰爭，朝廷也不會讓親王去帶兵，而是僅僅調動王府的護衛。所以當晚諸王已經不能參與任何軍事戰鬥，軍事指揮權自然早就沒了。
如永樂四年，朱棣爲了救蜀王，便調動三護衛還選了五千步軍，讓沐最操練，讓他進軍安南。在永樂七年，徵軍平叛軍，朝廷便派遣英國公張輔去，讓全國各都指揮使司和楚、遼、寧三王府發兵7千人一起前去。同年九月，讓江陰侯吳高，去選練山西及晉王府護衛步騎萬五千，寧陽伯陳憋，選練了陝西屬衛、慶秦二王府護衛步騎九千，還命令周、楚二王府護衛選步兵和騎兵跟隨，各自賜錢財，籌備糧食，到次年二月的時候，去北京隨徵。此外，有朝廷負責安排操練諸王府軍士。
雖然經過朱棣的這些削藩手段使得諸王權力不如從前了，但這次削藩並沒有斷絕後路，縱觀永樂一朝，還有很多的王府，依舊保留一定數量的護衛，這爲今後埋下了病根。他是解除諸王的軍事權力，但這隻限於他不放心的諸王。在永樂二年，朱棣分別冊封他的兩個兒子朱高煦、爲漢王和趙王，仍然留有了三護衛，他們可以參與軍事戰鬥並且還擁有軍事指揮權。
