中央軍主要有四大主力，其中關中軍團以舊秦國軍隊爲基礎，是帝國軍隊真正的精英(也有學者認爲正卒專指這隻軍隊)。另外三支軍隊根據其特點，姑且分別命名爲長城軍團，驪山軍團，嶺南軍團。這幾隻軍團(尤其是關中軍團)的命運決定着帝國的命運。
一、嶺南軍團的去向：嶺南軍團的統帥從屠雎到趙佗戰績都並不算太出彩，這隻軍隊平定嶺南地區後，即在當地駐紮。後來在秦末戰亂時，封鎖了五嶺邊界，沒有參與和影響中原戰事。
需要說明的是，第一，這隻軍隊的數量不可能達到50萬，史記沒有明確記載這隻軍隊的數量，50萬的來源是《淮南子》，錢穆認爲此書一向酷愛信口開河，嚴謹性可疑。就嶺南的戰略地位而言，皇帝陛下砸下五十萬的軍隊實在有點天方夜譚(想想看當年伐楚出六十萬軍隊皇帝陛下就心疼的要死)，如今歷史學界大多采信十萬左右的數字。估計將軍隊，移民，徭役，運輸的人數加在一起可能有五十萬。
秦朝疆域範圍
第二，這隻軍隊的素質應當爲四大主力最差，因其主要是以步兵(材官)和水兵(樓船士)爲主，幾乎沒有騎兵和車兵，所面對的對手主要是嶺南的部落酋長的武裝力量，但戰績卻乏善可陳。
第三，這隻軍隊之所以在秦末戰亂時選擇獨立，並非一開始就是對帝國政府不懷忠心，而欲獨立，很可能是因爲緊靠嶺南的東南地區原爲楚國故地，在秦末動亂時爲反叛最爲嚴重劇烈的地區，而嶺南軍團權衡兩方實力而不願受東南地區叛亂波及，危及自身，故在戰略上作出了自保的決定。
二、長城軍團的去向：長城軍團是帝國北方邊境的勇士長城，秦末戰亂前沿長城佈防以抗匈奴，平心而論，除開關中軍團，長城軍團實爲帝國最精銳的部隊，所部多有騎馬控弦之士，相當一部分軍隊也是以老秦國軍隊爲基礎並且久經戰陣。數量在最多時據史記記載達三十萬，秦末戰亂時在二十萬上下。長城軍團戰績顯赫，始皇帝三十二年，蒙恬率三十萬大軍北伐匈奴不到一年的時間擊退匈奴七百多裏，奪取匈奴內蒙古河套地區，屯兵於榆林。此時離秦末戰亂還不到四年。
秦末動亂髮生後，長城軍團第二任統帥王離(即王翦之孫)奉命領軍南下平叛，長城軍渡過黃河進入雁門關太原地區，後主要在燕趙舊地作戰，先是在趙國叛將李良的配合下攻滅了武臣的趙國政權，後趙歇在齊國支持下重建趙國，長城軍團的對手變成齊趙聯軍。公元前208年九月，長城軍團一部分人祕密南渡黃河，與濮陽驪山軍團聯合，於定陶擊敗楚軍，並殺死將軍項梁。不過這已經是長城軍團最後的輝煌了。
次年，長城軍團圍困齊趙聯軍與鉅鹿，眼看驪山援軍即將趕來，鉅鹿破城在即，未料到項羽搶先一步破釜沉舟渡過漳河，切斷了長城軍團與驪山軍團的聯繫，並在鉅鹿城下給予師老兵疲的長城軍團致命一擊，最終主帥王離被俘虜，兩位副帥一位戰死，一位自殺，長城軍團大部覆沒，餘部潰散。長城軍團沒落的最主要原因，在於缺少真正的帥才(比起蒙恬還有自己的爺爺，父親，王離只能算是庸才)和運氣不好(在當時任誰也想不到會殺出項羽這麼一個二愣子)。
三、驪山軍團的去向：驪山軍團是秦末戰亂中新建的軍團，數量大概在二十萬上下，主帥是章邯。驪山軍團取得了帝國平亂戰爭的最大勝利，也一手造就了平叛戰爭的最大失敗，真可謂功首罪魁非兩人，遺臭流芳本一身。
驪山軍團於秦二世二年初編成，主體是關中地區的農民以及驪山刑徒，武器裝備直接取自武庫，驪山軍團的編成由關中軍團直接監督，可能也有一部分爲關中軍團成員，儘管史記記載驪山軍團都是驪山刑徒，但是綜合秦朝當時的實際情況及後來的研究成果，全部爲驪山刑徒的可能性不大，驪山軍團於二世二年初同關中軍團擊潰周章軍並殺周章，繼而出關於十二月攻陷張楚首都陳縣，並消滅陳勝軍主力，陳勝於城父被車伕所殺。
驪山靈泉美景
再之後，在不到一年的時間內，驪山軍團要一鼓作氣，進入舊魏國地區，攻克魏國首都臨濟，平定魏國地區的叛亂，擊敗增援魏國的齊楚聯軍，殺死魏王田儋，二世二年九月，驪山軍團會和長城軍團於定陶擊敗楚軍，殺死項梁，取得了平叛的最大勝利。
二世三年初，驪山軍團幾乎撲滅了黃河南岸的所有叛軍，並渡過黃河，攻佔舊趙國首都邯鄲並圍困趙王於鉅鹿。驪山軍團本準備配合長城軍團圍點打援，消滅六國援軍。
